Suomen Harmonikkaliitto on kansainvälisen harmonikkaliiton Conféderation Internationale des Accordéonistes (CIA) jäsen. CIA:n kansainvälinen arkisto sijaitsee Harmonikkaliiton tiloissa Ikaalisissa. Arkiston tarkoituksena on tallentaa kaikki vuonna 1935 perustetun järjestön toimintaan liittyvä aineisto. Arkisto on karttunut merkittävällä tavalla, ja se on tärkeä myös Harmonikkaliiton kotimaisen toiminnan kannalta. CIA on Kansainvälisen musiikkineuvoston IMC:n (International Music Council) jäsen. IMC on UNESCOn virallinen yhteistyöjärjestö.
Suomen Harmonikkaliitto on myös kansainvälisen EAF:n (European Akkordeon Federation e.V.) jäsen. Järjestön toiminta keskittyy nuorten harmonikkaorkesterien toiminnan edistämiseen.